70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1344 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  60.42 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  62.5 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  57.29 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  54.17 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  55.79 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  52.13 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  52.13 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.4 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  42.55 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  44.9 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  44.9 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.38 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  44.9 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  44.9 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  39.78 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  43.88 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  44.68 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.68 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.39 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.37 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.36 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  41.3 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.8 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.36 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.67 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.35 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  35.87 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  39.8 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.78 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.99 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.76 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  37.76 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.99 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.38 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.38 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  30.11 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.29 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  34.02 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  34.41 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.21 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.3 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.12 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.58 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.58 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  29.17 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.53 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  33 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.27 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  29.47 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2982  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.47 
 
 		 97 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.57 
 
 		 129 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  28.57 
 
 		 109 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11290  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 52 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000335398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.63 
 
 		 100 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11021  hypothetical protein  28.87 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.672616  normal  0.0742145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.32 
 
 		 135 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>