48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2288 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  226  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.91 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.57 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  31 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11021  hypothetical protein  38.46 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.672616  normal  0.0742145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2982  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.25 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.25 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.33 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.33 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.93 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  30.19 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  30.19 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  30.19 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  28.85 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  28.85 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  30.67 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.38 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  29.41 
 
 		 300 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.21 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  28.42 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.93 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.12 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  31.96 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  30.49 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.79 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.86 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.12 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.26 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.49 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.12 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.17 
 
 		 146 aa  43.9  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.53 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.89 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  26.53 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.89 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  23.71 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  23.71 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  25 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  25.51 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  25.51 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>