61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1149 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 		 111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  59.6 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  50.5 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  46.67 
 
 		 300 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  48 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  48 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  48 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  48 
 
 		 256 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  48 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  49.02 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.12 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  45 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41.44 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  41.44 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  40.59 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  45.92 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45.92 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.47 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45.54 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  44.55 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41.41 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.4 
 
 		 100 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.39 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42.42 
 
 		 100 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  40 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  44.9 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.39 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  36.73 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.35 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  39.42 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.63 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.34 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.64 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  37 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  34.69 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.96 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  30.69 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0194  hypothetical protein  38.61 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.52 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.12 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.7 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.7 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0193  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.48 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0184  hypothetical protein  39.29 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.04 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  34.18 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0178  hypothetical protein  35.16 
 
 		 119 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  25.74 
 
 		 100 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.19 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.07 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.302437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>