51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0264 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  77.23 
 
 		 101 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0194  hypothetical protein  62.63 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  44.44 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  44.44 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.36 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.38 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.63 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  37.62 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  37.62 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.61 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  37.62 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  37.62 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  37.62 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  38.61 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  37.62 
 
 		 300 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  37.62 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.62 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.31 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.31 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.63 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.67 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.31 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.29 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.34 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.37 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  32.67 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  29.7 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.18 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.29 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.71 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.45 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.32 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  29.59 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.25 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  27.72 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  28.43 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  31 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.73 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  34.31 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.43 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  26.26 
 
 		 94 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0838  hypothetical protein  36.59 
 
 		 43 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0667726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>