52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6606 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.78 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38.95 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.31 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  41.41 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  40.28 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.31 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  36.46 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  38.71 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.38 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.3 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.3 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  31.91 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.91 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.63 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.04 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.63 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.04 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.59 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.92 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.36 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.29 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.29 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  28.26 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  36.46 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.61 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.38 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  33 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.53 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2982  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.21 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0194  hypothetical protein  41.86 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.9 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  25.51 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.55 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.55 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.21 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  30.3 
 
 		 101 aa  42.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.68 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  29.67 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.3 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  26.53 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.42 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.53 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  26.53 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.87 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>