55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2568 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  100 
 
 		 113 aa  238  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  63.04 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  48.08 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  48.08 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  48.08 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  50 
 
 		 256 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  50 
 
 		 300 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  48.08 
 
 		 190 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  47.12 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  47.96 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  47.96 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45.19 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  47 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  46 
 
 		 164 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  46 
 
 		 164 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  51.02 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41.41 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.4 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  40 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.4 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.38 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.39 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.21 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.36 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.4 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.35 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.08 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.93 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  35 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.87 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.73 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  32.35 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  37.89 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2422  hypothetical protein  37.11 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0667358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.67 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.04 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.04 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.85 
 
 		 95 aa  50.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  33.33 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  30.85 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.71 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.72 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  28.26 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.79 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  29.47 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  34.72 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0184  hypothetical protein  29.21 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  37.33 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0193  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.68 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.29 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0178  hypothetical protein  27.96 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2982  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.87 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>