61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4612 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 106 aa  218  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  62 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  64 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  58.76 
 
 		 100 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.76 
 
 		 107 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  59.79 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  54 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  41.41 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  40.4 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  40.4 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.8 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  40.4 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  40.4 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.39 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.38 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  38.38 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.38 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  38.38 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.73 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  37.76 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.67 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41.35 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.73 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.39 
 
 		 100 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.39 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.02 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  41.03 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  39.18 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.99 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.74 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  34 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38.46 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38.46 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.86 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.62 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.62 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  36.36 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.89 
 
 		 108 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  29.49 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.63 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.68 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.14 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.68 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.76 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  31 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.76 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0194  hypothetical protein  32.32 
 
 		 101 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>