39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1063 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  97.03 
 
 
101 aa  200  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2422  hypothetical protein  62.37 
 
 
109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0667358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  60.87 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  63.44 
 
 
109 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0193  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  51.65 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0184  hypothetical protein  50.55 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0178  hypothetical protein  49.45 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.99 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  34.04 
 
 
113 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.36 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.58 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  34 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  34 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  34 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  34 
 
 
256 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.04 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.04 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  34 
 
 
300 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  34 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  33.67 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.65 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.65 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.72 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.16 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.04 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  28.12 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  31.63 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.63 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.04 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.81 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.69 
 
 
97 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.69 
 
 
97 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.68 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.73 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>