56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4139 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 107 aa  221  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  66.34 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  61 
 
 		 100 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  62.89 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  59.79 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  57 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  58.76 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  47.47 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45.92 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  41.84 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.78 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  41.84 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  41.84 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  41.84 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  41.84 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  41.84 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.78 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.8 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  40.21 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.73 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.71 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.24 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.24 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.76 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.37 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  37.37 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.82 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  36.73 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.71 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  36.36 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42.31 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.65 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  43.59 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38.38 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.73 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  42.31 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.74 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.74 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  39.74 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.05 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.91 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  29.9 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.28 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.18 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  32.99 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.1 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.31 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.74 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  29.49 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  29.29 
 
 		 100 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  36.23 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  30.77 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  31.25 
 
 		 96 aa  40  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>