37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0590 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.31 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  36.27 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.98 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.31 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  30.61 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.35 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.65 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.68 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.73 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  31 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.53 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  30.19 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  30.19 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  35.53 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.9 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  32.89 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  29.7 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.72 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  31.58 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  30.19 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.71 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  28.12 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  29.9 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  29.7 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.29 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.83 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  28.28 
 
 		 100 aa  40  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  29.7 
 
 		 300 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>