68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0695 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 100 aa  199  7e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  89 
 
 		 100 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  82 
 
 		 100 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  65 
 
 		 100 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  65.66 
 
 		 100 aa  120  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  44.9 
 
 		 300 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  44.9 
 
 		 256 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45.92 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45.92 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  44.9 
 
 		 190 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  44.9 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  44.9 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  44.9 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.44 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 		 104 aa  93.2  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  43.88 
 
 		 100 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  43.88 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  43.88 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  45 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  40.4 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  40.4 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.38 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.4 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.82 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.38 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.73 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  42.42 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  39 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.76 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  39.8 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  38 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.27 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  32.32 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  37.37 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.35 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  39.39 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  29.7 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.28 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  33 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0838  hypothetical protein  60 
 
 		 43 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0667726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.3 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0194  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  25.25 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  28.71 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2422  hypothetical protein  27.72 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0667358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  30 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0193  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.29 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1763  transcription-repair coupling factor  36.59 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.356996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1144  stress responsive alpha-beta barrel  32.53 
 
 		 157 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>