60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4485 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  204  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  90 
 
 
100 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  67.01 
 
 
116 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61 
 
 
107 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  57.58 
 
 
101 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  59.79 
 
 
106 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  55.67 
 
 
102 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  44.55 
 
 
111 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.66 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  38.78 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  38.78 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  38.78 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  38.78 
 
 
256 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  38.78 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.73 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.76 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.63 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.63 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.65 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.71 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  38.61 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.78 
 
 
100 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.67 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  34.65 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.65 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.05 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.65 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  34.65 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  35 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41.03 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.68 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  31.96 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  39.74 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.37 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.7 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  35.9 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.29 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.61 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.63 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.05 
 
 
96 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  29 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0193  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.98 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.89 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.89 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  35.05 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.49 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0184  hypothetical protein  33.01 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.61 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.5 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.67 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.5 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0178  hypothetical protein  32.04 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  30.39 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  40  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>