36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0681 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  100 
 
 		 97 aa  199  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  51.55 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  51.55 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.34 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.93 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.29 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0045  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.72 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.58 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.29 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3925  stress responsive alpha-beta  29.41 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  22.92 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.9 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  29.47 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  24.47 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.57 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.32 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3356  stress responsive alpha-beta barrel  30.59 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426339  normal  0.411663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.17 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.72 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  29 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  25.74 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.12 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.55 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  32.32 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11021  hypothetical protein  28.28 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.672616  normal  0.0742145 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  27.37 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.63 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0680  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.24 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.16 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0877  stress responsive A/B barrel domain family protein  23.23 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0625  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.06 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  23.96 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  23.96 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>