40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1704 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  44.27 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  47.33 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  47.37 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0877  stress responsive A/B barrel domain family protein  36.73 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0181  stress responsive alpha-beta barrel  42.62 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00134163  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06521  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  40.4 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  40.4 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.71 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0682  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0045  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  34.34 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3400  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.77 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.917675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0680  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38.38 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0625  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.27 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08584  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.209026 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01204  conserved hypothetical protein  34.95 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.16484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1061  hypothetical protein  30.3 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  28.09 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.57 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.94 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.35 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.12 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.52 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.84 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  30.21 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.17 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.86 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  32.5 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.86 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  25 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0525  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.5 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000610518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.8 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.73 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0827  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.3 
 
 		 100 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>