65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0135 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 
100 aa  193  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  85 
 
 
100 aa  167  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  82 
 
 
100 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  65 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  65.66 
 
 
100 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  41 
 
 
101 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  42.86 
 
 
300 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.44 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  42.86 
 
 
256 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  43.88 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  43.88 
 
 
104 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42.86 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  41.84 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  44 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  42.86 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42.86 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  42.42 
 
 
111 aa  83.6  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  45.45 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.38 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 
107 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.73 
 
 
101 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.36 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 
100 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.36 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  35.35 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  38 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  38 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  34.69 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.73 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  40.82 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.27 
 
 
101 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.36 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  32.67 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  31.31 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  41 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34 
 
 
96 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34 
 
 
96 aa  60.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  36.36 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0838  hypothetical protein  62.5 
 
 
43 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0667726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.29 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.3 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  35.35 
 
 
94 aa  52  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  50.4  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0194  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  23.23 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  28.71 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.72 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2422  hypothetical protein  26.73 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0667358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.73 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>