36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8969 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  67.01 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  53.19 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  50.53 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  49.47 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.67 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.68 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.53 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.53 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  32 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.73 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8036  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.58 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.68 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  36.46 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.53 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.53 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.57 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.61 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.7 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0759  hypothetical protein  32.04 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  32.32 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.25 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.47 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2982  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.04 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  29.47 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0179  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.29 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0398383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  29.59 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.93 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  32.32 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  25.26 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.58 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>