33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3328 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  67.01 
 
 		 97 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  58.33 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  48.96 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  45.26 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0759  hypothetical protein  36 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  31.96 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.9 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.9 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.57 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.3 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.3 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.3 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8036  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.9 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  26.32 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  31.37 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.38 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.31 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2982  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.65 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.33 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  36.27 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.93 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0179  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.68 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0398383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.57 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.13 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0625  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.74 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0680  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.1 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3039  stress responsive alpha-beta barrel  30.1 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>