30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4769 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  48.12 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  47.37 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  45.26 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06521  hypothetical protein  41.05 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0877  stress responsive A/B barrel domain family protein  35.42 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0682  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.46 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0045  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08584  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.209026 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01204  conserved hypothetical protein  35.24 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.16484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0680  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.5 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1061  hypothetical protein  36.25 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0625  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.5 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0181  stress responsive alpha-beta barrel  34.45 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00134163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  30.93 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.37 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3400  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.83 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.917675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.21 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.21 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.29 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.29 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3925  stress responsive alpha-beta  25.93 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.4 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.26 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  24.47 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03100  expressed protein  28.7 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123827  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1763  transcription-repair coupling factor  31.25 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.356996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>