45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2425 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 		 146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  44.27 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  45.45 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  45.26 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06521  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0877  stress responsive A/B barrel domain family protein  33.33 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.02 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.02 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0045  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.29 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1061  hypothetical protein  32.32 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3400  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.04 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.917675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0181  stress responsive alpha-beta barrel  38.71 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00134163  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0625  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.32 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0680  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.32 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.92 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.7 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  32.14 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.63 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08584  conserved hypothetical protein  33.66 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.209026 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01204  conserved hypothetical protein  33.98 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.16484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0682  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.08 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.21 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  28.57 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  28.12 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.27 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.33 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03100  expressed protein  31.07 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  32.53 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 394 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.17 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3925  stress responsive alpha-beta  25.25 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.9 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.21 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  28.33 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.17 
 
 		 96 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3871  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.27 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.955674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0525  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.09 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000610518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.81 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.83 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>