71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1221 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  214  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.68 
 
 		 93 aa  83.6  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  40.95 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42.11 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  43.62 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  41.05 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  40.62 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  35.11 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.92 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.15 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.37 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  30.85 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.73 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.79 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.91 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.42 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.42 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.67 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.63 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.58 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.58 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.73 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  36.04 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  33.68 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  35.71 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  34.34 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.68 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  35.58 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  36.04 
 
 		 256 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2982  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.98 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  36.73 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  36.73 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.29 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  29.9 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.25 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  34.62 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1763  transcription-repair coupling factor  31.31 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.356996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.86 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.52 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  34.69 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.7 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.43 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.67 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1037  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.96 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  32.69 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.69 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8036  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.9 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0877  stress responsive A/B barrel domain family protein  27.55 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0682  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.08 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3356  stress responsive alpha-beta barrel  28.89 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426339  normal  0.411663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.29 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  33.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.8 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3925  stress responsive alpha-beta  27 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06521  hypothetical protein  23.96 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.17 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2435  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.33 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.23719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.8 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4395  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.43 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0488  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.77 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.87 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.55 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3261  hypothetical protein  35 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.332933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>