35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1430 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  100 
 
 
96 aa  196  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  59.38 
 
 
101 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  60.87 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  55.43 
 
 
109 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2422  hypothetical protein  54.35 
 
 
109 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0667358 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0193  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  52.13 
 
 
97 aa  106  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0184  hypothetical protein  53.19 
 
 
97 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0178  hypothetical protein  52.13 
 
 
119 aa  103  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38.14 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.35 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  34.65 
 
 
104 aa  52  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  34.65 
 
 
104 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34 
 
 
102 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.02 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  34.65 
 
 
147 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  34.65 
 
 
190 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  34.65 
 
 
256 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  33.33 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  33.66 
 
 
300 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.77 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.07 
 
 
102 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.07 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.07 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  29.81 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.81 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.68 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.37 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.18 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.31 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
107 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>