61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1810 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  100 
 
 		 104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  88.46 
 
 		 104 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  88.46 
 
 		 104 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  87.5 
 
 		 164 aa  193  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  87.5 
 
 		 164 aa  193  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  86.54 
 
 		 104 aa  189  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  77.88 
 
 		 256 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  77.88 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  77.88 
 
 		 104 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  77.88 
 
 		 104 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  77.88 
 
 		 190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  75.96 
 
 		 300 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  53.06 
 
 		 100 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  56 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  46.94 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  44.9 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45.92 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  47.96 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  43.88 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  51 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42.86 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  40 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.82 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  42.86 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.64 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  36.63 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.31 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.78 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.37 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.64 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  41 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.69 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  37.62 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.57 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  37.62 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.62 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.67 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.62 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.01 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  28.57 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  32 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0045  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.05 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.04 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  31.07 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  30 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.93 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.93 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.12 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3402  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.88 
 
 		 99 aa  42  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  29.7 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3925  stress responsive alpha-beta  34.04 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>