61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A3380 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  100 
 
 
256 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  214  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  98.08 
 
 
300 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  82.69 
 
 
104 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  81.73 
 
 
104 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  80.77 
 
 
104 aa  176  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  80.77 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  80.77 
 
 
164 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  77.88 
 
 
104 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  77.88 
 
 
104 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  53.06 
 
 
102 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2920  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  56.57 
 
 
100 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  48 
 
 
111 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  48.08 
 
 
113 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  48.98 
 
 
100 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42.86 
 
 
100 aa  90.5  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  44.12 
 
 
101 aa  88.6  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42.86 
 
 
100 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.8 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44 
 
 
101 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1778  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  84.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0751703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.8 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  42 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.4 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.84 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.76 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  38.78 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  44.9 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  41.84 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.62 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.6 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.76 
 
 
95 aa  66.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33.67 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  40.4 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  40.4 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.37 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.36 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1430  stress responsive alpha-beta barrel  34.65 
 
 
96 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.19 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  33.66 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  27 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0193  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.73 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.97 
 
 
107 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.35 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.35 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.35 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004310  BR0184  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.19 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  33 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0194  hypothetical protein  41.41 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0178  hypothetical protein  29.81 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0682  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.65 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2817  stress responsive alpha-beta barrel  32.35 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>