44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0652 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  206  7e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.67 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.65 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  28.71 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.05 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  32 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  35.35 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.72 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.37 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  33 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.37 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  33.33 
 
 		 256 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.29 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.31 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.18 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.68 
 
 		 100 aa  42  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.68 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  30.39 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.68 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  25.74 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.7 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 		 107 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.43 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  21 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.28 
 
 		 99 aa  40  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  30.39 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.39 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  26 
 
 		 97 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>