54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3290 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 		 96 aa  197  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  61.7 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  57.89 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  59.57 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  61.7 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  48.94 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  52.13 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  46.32 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.17 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.62 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.11 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1501  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.36 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.74 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  39.24 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  34.04 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.18 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.25 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38.46 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  38.61 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.05 
 
 		 102 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.44 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.28 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.67 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.62 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.62 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.62 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2146  hypothetical protein  35.35 
 
 		 300 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  30.53 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1900  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.63 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36.63 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6179  stress responsive alpha-beta barrel  36.63 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.37 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2244  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.37 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2328  hypothetical protein  35.35 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3380  hypothetical protein  35.35 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0264  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1924  hypothetical protein  35.35 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2289  hypothetical protein  37 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0229894  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2451  stress responsive A/B barrel domain family protein  37 
 
 		 256 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1763  transcription-repair coupling factor  34.62 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.356996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.86 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0194  hypothetical protein  32 
 
 		 101 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.38 
 
 		 100 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  29.41 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>