41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3797 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 		 129 aa  263  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  51.26 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  47.33 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  45.45 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06521  hypothetical protein  45.83 
 
 		 98 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0877  stress responsive A/B barrel domain family protein  45.83 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  43.75 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0682  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  40.62 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0045  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  43 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  35.11 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0181  stress responsive alpha-beta barrel  32.28 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00134163  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35.56 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1061  hypothetical protein  34.34 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3400  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.77 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.917675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33.67 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0625  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.32 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0680  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.32 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0525544 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01204  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.16484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.87 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.87 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08584  conserved hypothetical protein  29.7 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.209026 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.57 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  29.9 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2422  hypothetical protein  29.63 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0667358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4555  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.81 
 
 		 214 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0914316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1665  hypothetical protein  37 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0308799  normal  0.297476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.93 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.04 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  34.04 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0488  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  25.6 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2568  stress responsive alpha-beta barrel  29.29 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.152211  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.63 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1770  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.61 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.013973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.04 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.302437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  26.25 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.57 
 
 		 93 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  26.04 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0199  hypothetical protein  27.35 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.1606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>