27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0680 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0680  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 		 102 aa  206  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0625  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  91.18 
 
 		 102 aa  193  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1061  hypothetical protein  63.37 
 
 		 102 aa  143  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0045  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  45.45 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  38.38 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  37.5 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3356  stress responsive alpha-beta barrel  29.41 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426339  normal  0.411663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0682  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.31 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3925  stress responsive alpha-beta  32.35 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.32 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.32 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0877  stress responsive A/B barrel domain family protein  27.45 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4176  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.3 
 
 		 394 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346853  hitchhiker  0.000695283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.94 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.94 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08584  conserved hypothetical protein  32.97 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.209026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  25.25 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0181  stress responsive alpha-beta barrel  29.91 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00134163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  28.24 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  31.53 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1770  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.56 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.013973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.82 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.25 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.11 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>