More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0313 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0313  FtsW/RodA/SpoVE family peptidoglycan biosynthesis protein  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2174  Cell division membrane protein-like protein  40.24 
 
 		 430 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0173253  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  38.92 
 
 		 366 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  40.61 
 
 		 374 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  40.61 
 
 		 374 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  41.36 
 
 		 365 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  40.74 
 
 		 377 aa  117  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  40.85 
 
 		 380 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  38.12 
 
 		 366 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  42.07 
 
 		 378 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  39.51 
 
 		 369 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  37.65 
 
 		 366 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  37.72 
 
 		 366 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  38.55 
 
 		 421 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  38.51 
 
 		 407 aa  112  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0955  cell cycle protein FtsW  35.44 
 
 		 423 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1031  cell division protein FtsW  39.51 
 
 		 467 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  41.92 
 
 		 419 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  38.69 
 
 		 368 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.65 
 
 		 366 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  39.39 
 
 		 438 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  37.95 
 
 		 388 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  33.95 
 
 		 386 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  39.1 
 
 		 426 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  38.89 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  38.65 
 
 		 364 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  39.63 
 
 		 387 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  38.75 
 
 		 371 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  40.85 
 
 		 417 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  40.85 
 
 		 417 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  39.87 
 
 		 374 aa  108  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  38.04 
 
 		 412 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  37.04 
 
 		 412 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.14 
 
 		 423 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  36.2 
 
 		 373 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  36.25 
 
 		 365 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 371 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  38.55 
 
 		 422 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  38.79 
 
 		 379 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  36.14 
 
 		 427 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 376 aa  106  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 		 372 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 366 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  37.27 
 
 		 366 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  38.27 
 
 		 422 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.81 
 
 		 376 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  35.5 
 
 		 371 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1204  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  36.6 
 
 		 423 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00857076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  36.02 
 
 		 421 aa  104  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  38.75 
 
 		 373 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  36.65 
 
 		 387 aa  104  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  38.75 
 
 		 373 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1112  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  36.6 
 
 		 421 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000013598 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0955  cell cycle protein FtsW  36.6 
 
 		 421 aa  104  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  34.78 
 
 		 367 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  35.29 
 
 		 363 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  38.12 
 
 		 369 aa  104  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  34.97 
 
 		 361 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  37.65 
 
 		 422 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  37.04 
 
 		 373 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 384 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  34.73 
 
 		 381 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  34.73 
 
 		 381 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 		 403 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  36.25 
 
 		 366 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 		 364 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  36.09 
 
 		 371 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  39.29 
 
 		 378 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  36.59 
 
 		 370 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0966  cell cycle protein FtsW  37.34 
 
 		 416 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000140242  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1034  cell cycle protein FtsW  37.34 
 
 		 392 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000276765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0779  cell cycle protein  36.88 
 
 		 390 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 376 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.33 
 
 		 368 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  39.29 
 
 		 378 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6114  cell division protein FtsW  32.04 
 
 		 417 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309326  normal  0.0125207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.92 
 
 		 368 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  38.1 
 
 		 372 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  36.09 
 
 		 384 aa  101  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0944  cell cycle protein FtsW  37.34 
 
 		 392 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000881234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  33.95 
 
 		 386 aa  101  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  37.2 
 
 		 412 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  36.42 
 
 		 376 aa  101  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1634  cell cycle protein  36.2 
 
 		 391 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  37.13 
 
 		 382 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  35.19 
 
 		 379 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.16 
 
 		 368 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 		 379 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  38.27 
 
 		 417 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 		 371 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  36.97 
 
 		 366 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1073  cell division protein, FtsW/RodA/SpoVE family  36.25 
 
 		 418 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.90207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 		 412 aa  99.8  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  37.13 
 
 		 362 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 382 aa  99  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1251  cell cycle protein  36.9 
 
 		 383 aa  99.4  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.450877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 368 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  34.16 
 
 		 379 aa  99  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  36.88 
 
 		 433 aa  98.6  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  32.53 
 
 		 380 aa  98.6  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>