More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1162 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1162  L-aspartate oxidase  100 
 
 
512 aa  987    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  45.93 
 
 
522 aa  356  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  45.53 
 
 
529 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  42.43 
 
 
515 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  42.89 
 
 
545 aa  336  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 
515 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  37.74 
 
 
532 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  44.13 
 
 
577 aa  332  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  40.22 
 
 
571 aa  332  9e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  40.84 
 
 
565 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  43.91 
 
 
541 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  41.55 
 
 
532 aa  330  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  45.56 
 
 
863 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  41.99 
 
 
528 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  37.02 
 
 
531 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.19 
 
 
542 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  38.58 
 
 
534 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  43.84 
 
 
507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  37.52 
 
 
531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  45.26 
 
 
867 aa  321  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  39.44 
 
 
533 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  47.7 
 
 
556 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  37.98 
 
 
531 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  41.5 
 
 
543 aa  318  2e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  43.81 
 
 
534 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  38.11 
 
 
538 aa  316  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  38.03 
 
 
531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
535 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
535 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
535 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  39.18 
 
 
556 aa  313  5.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  45.71 
 
 
538 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  44.89 
 
 
532 aa  312  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  39.35 
 
 
539 aa  312  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  46.38 
 
 
847 aa  312  9e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  46.82 
 
 
545 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  37.02 
 
 
537 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0862  L-aspartate oxidase  40.3 
 
 
549 aa  309  8e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  37.33 
 
 
531 aa  309  8e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  46.22 
 
 
558 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  44.95 
 
 
537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  45.45 
 
 
575 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0833  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  39.56 
 
 
558 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 
579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  39.56 
 
 
557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 
534 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  39.73 
 
 
535 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  42.4 
 
 
550 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 
536 aa  306  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  42.58 
 
 
535 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  39.93 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  40.41 
 
 
609 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  39.77 
 
 
541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  41.1 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  43.61 
 
 
531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  43.71 
 
 
572 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  36.22 
 
 
531 aa  303  7.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  40.28 
 
 
536 aa  302  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  40.28 
 
 
536 aa  302  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  43.03 
 
 
516 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2374  L-aspartate oxidase  39.46 
 
 
558 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  41 
 
 
483 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  39.73 
 
 
538 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 
535 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
534 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  40.88 
 
 
534 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 
537 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 
537 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 
537 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
534 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 
534 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  39.7 
 
 
533 aa  301  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  41.18 
 
 
541 aa  300  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  39.55 
 
 
537 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 
537 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  38.65 
 
 
531 aa  300  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  40.3 
 
 
537 aa  300  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  44.65 
 
 
518 aa  299  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  40.61 
 
 
538 aa  299  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  38.8 
 
 
538 aa  299  9e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  38.8 
 
 
538 aa  299  9e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  43.42 
 
 
540 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  39.37 
 
 
537 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  40.5 
 
 
546 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  37.57 
 
 
533 aa  298  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2315  L-aspartate oxidase  42.19 
 
 
528 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  39.18 
 
 
537 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  38.27 
 
 
542 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.2 
 
 
472 aa  297  3e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  42.55 
 
 
557 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  39.74 
 
 
536 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  40.34 
 
 
538 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  38.96 
 
 
539 aa  296  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  39.73 
 
 
537 aa  296  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2375  L-aspartate oxidase  39.76 
 
 
559 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  45.07 
 
 
539 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  39.39 
 
 
542 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 
541 aa  296  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  39.85 
 
 
538 aa  296  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>