119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2348 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2348  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936132  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5369  protein of unknown function DUF159  38.6 
 
 
272 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4648  protein of unknown function DUF159  35.88 
 
 
277 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  hitchhiker  0.00000000524606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  31.75 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  24.07 
 
 
254 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  29.85 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  29.05 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  28.28 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0318  protein of unknown function DUF159  27.78 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.527161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  27.93 
 
 
222 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  32.1 
 
 
221 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  26.48 
 
 
238 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  32.14 
 
 
233 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  27.55 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  27.95 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  29.24 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  29.11 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  29.11 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  23.89 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  30.38 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  25.71 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  26.92 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  28.21 
 
 
218 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  33.63 
 
 
222 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  25.64 
 
 
226 aa  55.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  25.9 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  26.74 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.56 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  26.45 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  25.52 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25.31 
 
 
197 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  26.76 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  25.32 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  24.61 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  31.82 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  25.99 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  24.44 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  26.04 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  30.32 
 
 
222 aa  52.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  25.15 
 
 
252 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  27.45 
 
 
253 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  27.78 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  24.42 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  27.27 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  26.97 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  27.01 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  26.54 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  28.25 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  27.38 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  30.08 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  27.85 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  25.73 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  25.73 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  28.22 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  25.27 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  23.95 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  25.76 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  25.62 
 
 
215 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  27.37 
 
 
217 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  23.81 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  27.33 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  27.33 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  26.29 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  26.64 
 
 
226 aa  49.3  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  26.54 
 
 
274 aa  49.3  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  26.57 
 
 
252 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  28.17 
 
 
232 aa  48.9  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  31.08 
 
 
224 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  25.97 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  27.84 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  25.32 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  28.67 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  24.41 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  22.83 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  27.64 
 
 
268 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  33.9 
 
 
231 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  28.19 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  26.58 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  24.44 
 
 
252 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  27.46 
 
 
236 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  26.67 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  24.71 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48297  hypothetical protein  29.45 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  23.88 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  27.11 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  30.19 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  26.43 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04161  DUF159 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13150)  22.6 
 
 
388 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0736847  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1441  hypothetical protein  26.29 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  22.99 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  25.28 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  26.45 
 
 
220 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  25.43 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  23.7 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  23.29 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  25.47 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  23.78 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>