53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4648 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4648  protein of unknown function DUF159  100 
 
 		 277 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  hitchhiker  0.00000000524606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5369  protein of unknown function DUF159  53.82 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2348  protein of unknown function DUF159  35.88 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0936132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  29.31 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3570  hypothetical protein  27.57 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  28.57 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  25.14 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07175  hypothetical protein  25.26 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00624885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  29.35 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  28.19 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  23.98 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13240  hypothetical protein  25.54 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00426355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  24.84 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  23.94 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  26.11 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  26.9 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  26.96 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  25.57 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  27.39 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  24.71 
 
 		 337 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  25.57 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  24.72 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  24.34 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  24.5 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  24.77 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  26.97 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  25.14 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  24.71 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  25.14 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  25.68 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  25.14 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  22.67 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  26.7 
 
 		 224 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  27.14 
 
 		 222 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  25.98 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  26.13 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  26.13 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  25.44 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  23.42 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  24.32 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15591  hypothetical protein  24.02 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  22.87 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  21.16 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  24.41 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  22.29 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  23.89 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  24.87 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1207  hypothetical protein  23.85 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  23.08 
 
 		 236 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  23.56 
 
 		 242 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  27.07 
 
 		 232 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>