More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5120 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
320 aa  601  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.73 
 
 
320 aa  338  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 
319 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
313 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.55 
 
 
313 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  39.17 
 
 
313 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.12 
 
 
314 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673833  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8312  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  38.92 
 
 
317 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.577715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
315 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0708639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
339 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
319 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  38.17 
 
 
318 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
314 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5642  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  39.81 
 
 
316 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0251003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
322 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
313 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
322 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
322 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
313 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.63 
 
 
313 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
313 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
315 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  35.67 
 
 
315 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
318 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
313 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
313 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
306 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
315 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
320 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.48 
 
 
308 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
313 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
313 aa  202  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.26 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488375  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
313 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  38.46 
 
 
298 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00994535  normal  0.14386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  41.27 
 
 
313 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
306 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
313 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.965219  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.54 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  37.85 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  35.65 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  38.54 
 
 
327 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
313 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
306 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
306 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
314 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1925  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.68 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.730701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 
316 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
311 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
314 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
306 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
306 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  38.22 
 
 
306 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
306 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
315 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  36.53 
 
 
336 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
306 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  38.22 
 
 
306 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  37.9 
 
 
306 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.99 
 
 
306 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
302 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
306 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
306 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
306 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 
333 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
306 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
306 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.94 
 
 
306 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.93 
 
 
336 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.94 
 
 
306 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
306 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.94 
 
 
306 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  36.94 
 
 
306 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
321 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.94 
 
 
306 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
306 aa  192  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.94 
 
 
306 aa  192  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
307 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
307 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
313 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.9 
 
 
313 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
315 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
321 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  37.39 
 
 
336 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
306 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
313 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  35.61 
 
 
351 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>