More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5114 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
297 aa  573  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459842  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.77 
 
 
288 aa  228  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0183077  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
293 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2959  ABC transporter related  39.68 
 
 
599 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  35.06 
 
 
867 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.19 
 
 
299 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.19 
 
 
299 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  34.19 
 
 
299 aa  168  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  34.19 
 
 
299 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.19 
 
 
299 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
277 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
299 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
313 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
310 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 
282 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  35.38 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5257  putative ABC transporter (permease protein)  35.79 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216925  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
301 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 
331 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1223  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.36 
 
 
296 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
299 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.7 
 
 
284 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.36 
 
 
293 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
304 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
283 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
288 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0323397 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1273  ABC transporter, ATP-binding/permease  36.78 
 
 
650 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
296 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
299 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
280 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  31.9 
 
 
283 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  31.9 
 
 
283 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
305 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
283 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
296 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0788732  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
310 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1323  nickel transporter permease NikC  34.48 
 
 
277 aa  158  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00536272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  31.54 
 
 
283 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7616  nickel transporter permease NikC  34.7 
 
 
291 aa  158  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
308 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848897  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
292 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.5 
 
 
321 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
283 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  32.23 
 
 
310 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
283 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
305 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.84 
 
 
306 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
297 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
298 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0718  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
298 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
283 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  31.54 
 
 
283 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
303 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11217  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3031  ABC peptide/opine transporter, inner membrane subunit  37.87 
 
 
297 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3645  ABC transporter related  39.64 
 
 
599 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  32.21 
 
 
302 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0184  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.2 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.4 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  34.24 
 
 
279 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  32.58 
 
 
300 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
309 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0811  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.56 
 
 
308 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261533  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  35.63 
 
 
300 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
291 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.532821  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  33.46 
 
 
304 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4025  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
296 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
299 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  35.21 
 
 
308 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046213 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
296 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 
302 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
295 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  32.21 
 
 
300 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
286 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4119  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  34.31 
 
 
282 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0802  nickel transporter permease NikC  34.55 
 
 
290 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
280 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
305 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
278 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0952  peptide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
286 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
293 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
278 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0280808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
302 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2420  dipeptide ABC transport system inner membrane binding component DppC  32.87 
 
 
288 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000767733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0407  peptide ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 
302 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
650 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
280 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
293 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
305 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.380903 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
296 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
305 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
305 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
294 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
305 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
299 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>