106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2227 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2227  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 71 aa  141  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  38.03 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  37.31 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  38.03 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  36.62 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  36.23 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3943  putative acyl carrier protein  35.71 
 
 		 78 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  32.86 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  37.31 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  33.33 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0414  putative acyl carrier protein  40 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230506  normal  0.0244859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  32.39 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  39.39 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  37.88 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  37.88 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  30.88 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  28.99 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  30 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2339  putative acyl carrier protein  28.99 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  33.85 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  36.36 
 
 		 77 aa  43.9  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 88 aa  43.9  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 77 aa  43.9  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  32.79 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2666  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1026  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0283  acyl carrier protein, ACP  30.77 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  26.47 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  32.31 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  32.39 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  31.75 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  37.68 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  26.87 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  30.43 
 
 		 77 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0345  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 74 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0352923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1634  putative acyl carrier protein  37.93 
 
 		 78 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0265419  normal  0.0223773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  28.36 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  27.14 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 77 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 78 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  28.36 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  28.36 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0184  putative acyl carrier protein  36 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  28.36 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2628  putative acyl carrier protein  30.88 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00674  hypothetical protein  39.06 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6430  putative acyl carrier protein (ACP)  30 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1534  putative acyl carrier protein  36 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  32.35 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0430  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000189209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  28.79 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  32.86 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3110  acyl carrier protein  36.51 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.015067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>