54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7078 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7078  putative outer membrane protein  100 
 
 		 491 aa  993    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0823525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2351  Outer membrane protein-like protein  37.63 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5610  outer membrane efflux protein  35.6 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0285  hypothetical protein  30.43 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25.38 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 1496 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  23.6 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  27.12 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 444 aa  51.6  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.33 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.13 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.45 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  26.37 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  24.14 
 
 		 493 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  23.73 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.54 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  25.17 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.28 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.28 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.28 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.01 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.29 
 
 		 495 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 449 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  24.52 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.25 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.36 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.26 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  29.5 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  25.07 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.67 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0637  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 456 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.358934  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1062  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0664655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 460 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0711  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 456 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.58 
 
 		 478 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  20.62 
 
 		 470 aa  43.9  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0414  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  25.52 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  25.7 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4684  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.52 
 
 		 494 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.37 
 
 		 428 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.41 
 
 		 498 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>