31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0285 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0285  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1021    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7078  putative outer membrane protein  31.73 
 
 		 491 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0823525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5610  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 482 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2351  Outer membrane protein-like protein  30.02 
 
 		 495 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 1496 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.1 
 
 		 452 aa  53.9  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.94 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 455 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.65 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  33.04 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.28 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  22.42 
 
 		 484 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.84 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.9 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2529  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26 
 
 		 485 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.63 
 
 		 470 aa  44.3  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.75 
 
 		 488 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1086  TolC protein  22.89 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23.5 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 497 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 459 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.47 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  19.61 
 
 		 448 aa  43.5  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.9 
 
 		 456 aa  43.1  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.44 
 
 		 465 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>