60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3777 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3777  peptidase M23B  100 
 
 		 283 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000155836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0107  peptidase M23B  27.44 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  28.8 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1795  Peptidase M23  25.25 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17750  peptidase M23B  22.59 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  25.81 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  26.4 
 
 		 507 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1947  Peptidase M23  33.33 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.653444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  28.41 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  27.48 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2837  Peptidase M23  30.71 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  32.99 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  29.2 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  25.79 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3146  peptidase M23B  25.47 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  30.83 
 
 		 375 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  31.96 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  28.32 
 
 		 386 aa  48.9  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  28.32 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  30.93 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  31.19 
 
 		 482 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  32.26 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  31.03 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  26.92 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  25.95 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  36.08 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  33 
 
 		 605 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  29.51 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  28.57 
 
 		 423 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  24.86 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  34.04 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  25.42 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  31.87 
 
 		 420 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  34.04 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  30.1 
 
 		 610 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  28.95 
 
 		 441 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  26.9 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  30.11 
 
 		 141 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  30.11 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  25.26 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.07 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  30.48 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  32.97 
 
 		 412 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  25 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  30.85 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  23.2 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  28.7 
 
 		 387 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  27.52 
 
 		 581 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  25.71 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  31.78 
 
 		 420 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  30.63 
 
 		 577 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  30.63 
 
 		 577 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  29.75 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  25.66 
 
 		 385 aa  43.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  31.25 
 
 		 541 aa  43.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  28.9 
 
 		 455 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  26.21 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  30 
 
 		 439 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  25.98 
 
 		 388 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  32.63 
 
 		 279 aa  42.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>