260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1080 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1080  peptidase U32  100 
 
 		 318 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.554498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2987  peptidase U32  26.92 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0684  peptidase U32  23.55 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0768  peptidase U32  25.16 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  25.63 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  30.07 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  26.97 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  25.75 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  28.12 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  28.5 
 
 		 667 aa  69.3  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  24.92 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  27.37 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  30.14 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  24.75 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  27.14 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0673  peptidase U32  27.64 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  25.25 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  25.25 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0183  putative protease  25.78 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  27.04 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  24.84 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  28.27 
 
 		 822 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002618  putative protease  25.63 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0594  peptidase U32  26.53 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  27.23 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  27.37 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  22.76 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0818  peptidase U32  26.12 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.66707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  22.76 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  22.76 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  22.76 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  22.76 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  22.76 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  22.76 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  22.76 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  27.35 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  22.67 
 
 		 826 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  26.84 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  22.76 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  22.41 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  28.65 
 
 		 838 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  26.84 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1234  peptidase U32  25.39 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  22.03 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03388  protease  25.21 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3595  peptidase U32  24.9 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.04534 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4228  peptidase U32  25.52 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2234  hypothetical protein  27.95 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00649369  normal  0.770336 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  26.04 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  26.84 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  26.84 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0504  peptidase U32  23.48 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1195  putative protease  25.41 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13290  putative protease  25.41 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.332968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3582  U32 family peptidase  24.9 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3715  peptidase U32  24.9 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4010  U32 family peptidase  24.9 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0711  peptidase U32  22.57 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  25.49 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3337  peptidase U32  24.7 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  25.79 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3614  peptidase, U32 family  24.9 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0540  peptidase U32  24.9 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  23.51 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1849  peptidase U32  29.5 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3454  U32 family peptidase  24.9 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3350  U32 family peptidase  24.9 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3640  U32 family peptidase  24.9 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03025  predicted peptidase (collagenase-like)  24.9 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0547  peptidase U32  25.39 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4477  peptidase, U32 family  24.9 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02976  hypothetical protein  24.9 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  24.91 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3463  peptidase, U32 family  24.48 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3629  peptidase, U32 family  24.48 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3569  peptidase, U32 family  24.48 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3461  peptidase, U32 family  24.48 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3532  peptidase, U32 family  24.48 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1864  peptidase U32  29.27 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  24.87 
 
 		 434 aa  55.8  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3456  peptidase U32  21.94 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.404335  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0605  putative peptidase  24.79 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2386  peptidase U32  25 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  26.8 
 
 		 438 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  27.69 
 
 		 783 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  24.31 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0465  putative protease  25 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2117  peptidase U32  25 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.871657  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  27.03 
 
 		 548 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0136  peptidase U32  26.07 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027023  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  26.84 
 
 		 696 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  27.45 
 
 		 440 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  29.63 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  22.04 
 
 		 877 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  25.52 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  26.94 
 
 		 716 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  29.53 
 
 		 835 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  27.74 
 
 		 469 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0716  peptidase U32  22.19 
 
 		 408 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0755954  normal  0.409296 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  21.32 
 
 		 420 aa  52.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>