More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2001 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2001  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2922  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  78.64 
 
 		 206 aa  333  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11213  putative Sua5/yciO/yrdC family protein  73.17 
 
 		 206 aa  313  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3021  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  66.67 
 
 		 206 aa  283  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.539873  normal  0.0225274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5017  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.95 
 
 		 208 aa  269  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1614  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.56 
 
 		 206 aa  257  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.199609 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1076  translation factor SUA5  52.71 
 
 		 208 aa  237  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0717  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.28 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.766931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.15 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.61 
 
 		 221 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.61 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.63 
 
 		 221 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  43.48 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  45.41 
 
 		 207 aa  184  7e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  39.61 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  45.37 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  42.72 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  43.2 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  43.2 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  43.2 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.2 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  43.2 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  43.2 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  43.2 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  43.2 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  43.2 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  44.88 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  41.75 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  42.51 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  42.51 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  42.51 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  42.51 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.96 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  41.55 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  42.51 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.45 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  42.16 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.84 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.16 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.06 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.71 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  43 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.81 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.46 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2120  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.67 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781433  hitchhiker  0.000757724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.18 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.29 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.35 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.57 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  43.48 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2116  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.72 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.839718  normal  0.0783676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  42.44 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  42.03 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  42.03 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1527  putative translation factor Sua5  39.42 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.38 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.83 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.06 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.45 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  41.06 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  41.46 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.35 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.35 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.35 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.55 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  41.06 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  34.13 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1684  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.86 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.57 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  39.22 
 
 		 206 aa  161  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.76 
 
 		 208 aa  160  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.07 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3016  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.51 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  39.22 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.38 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  42.86 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.38 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.89 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1522  translation factor SUA5  42.51 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0107346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.67 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.1 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1464  translation factor SUA5  42.51 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1530  translation factor SUA5  42.51 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.473863  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.39 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.18 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.38 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2168  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.24 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.426518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.24 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2401  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.55 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.907805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2699  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.55 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.71 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2799  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.55 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.703819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1666  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.55 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00411691  hitchhiker  0.000419541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2720  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.55 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1688  translation factor SUA5  39.51 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.41 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2623  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.41 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1682  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.41 
 
 		 209 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824894  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.76 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>