More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1398 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  99.51 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  63.41 
 
 		 207 aa  283  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  63.59 
 
 		 207 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  62.93 
 
 		 209 aa  278  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  63.59 
 
 		 209 aa  276  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  63.9 
 
 		 222 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.93 
 
 		 221 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.44 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  61.65 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  62.14 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  61.95 
 
 		 209 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.95 
 
 		 209 aa  268  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  62.14 
 
 		 206 aa  268  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  62.14 
 
 		 206 aa  268  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.95 
 
 		 221 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.46 
 
 		 221 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  60.68 
 
 		 206 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.74 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1876  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  59.02 
 
 		 209 aa  261  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  58.74 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  60 
 
 		 218 aa  261  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  60 
 
 		 218 aa  261  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.5 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.46 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  60.98 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  60.98 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.77 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3395  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.56 
 
 		 210 aa  258  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000157314  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  60 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  58.25 
 
 		 206 aa  257  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.51 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.02 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.05 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.54 
 
 		 213 aa  254  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  59.51 
 
 		 206 aa  255  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  60.49 
 
 		 206 aa  254  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1038  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0976  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  57.28 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.37 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  56.59 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  57.28 
 
 		 207 aa  250  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.1 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.44 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1684  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.12 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  62.44 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  57.07 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.1 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.51 
 
 		 206 aa  248  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.1 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  54.85 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.88 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.1 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.4 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3133  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.59 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2184  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.59 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1682  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.59 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2623  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.59 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2702  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.59 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.59 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2569  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.59 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.1 
 
 		 209 aa  244  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.44 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.66 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.37 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1141  hypothetical protein  56.93 
 
 		 207 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  54.15 
 
 		 210 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2552  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.15 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000159631  normal  0.146641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1581  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family translation factor  54.15 
 
 		 211 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132885  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12460  translation factor SUA5  54.41 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.149253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.45 
 
 		 207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3016  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 206 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1527  putative translation factor Sua5  54.85 
 
 		 207 aa  237  6.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2401  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.56 
 
 		 206 aa  237  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.907805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.5 
 
 		 207 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.2 
 
 		 215 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0149272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1666  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 206 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00411691  hitchhiker  0.000419541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1688  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.56 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2720  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 206 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2699  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 206 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2799  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 206 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.703819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1522  translation factor SUA5  56.1 
 
 		 206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0107346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  50.97 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1464  translation factor SUA5  55.61 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1530  translation factor SUA5  55.61 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.473863  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1728  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.856761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.46 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>