More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2209 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.02 
 
 		 205 aa  264  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.21 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.5 
 
 		 209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  55.56 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  58.13 
 
 		 210 aa  248  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.71 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  56.72 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  53.96 
 
 		 215 aa  244  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0149272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.69 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.07 
 
 		 211 aa  244  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.72 
 
 		 206 aa  244  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  53.69 
 
 		 207 aa  244  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.23 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.23 
 
 		 207 aa  241  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1684  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.45 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2552  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.71 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000159631  normal  0.146641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3395  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.23 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000157314  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  53.23 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  55.22 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.48 
 
 		 210 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1581  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family translation factor  52.22 
 
 		 211 aa  238  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132885  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.98 
 
 		 206 aa  238  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.46 
 
 		 206 aa  238  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.24 
 
 		 221 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.48 
 
 		 210 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  56.65 
 
 		 207 aa  238  6.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.24 
 
 		 221 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.97 
 
 		 210 aa  237  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  53.47 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.47 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  53.47 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  52.5 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  52.5 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  53.47 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  52.43 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  53.47 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  52.43 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.47 
 
 		 209 aa  236  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  53.47 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  53.47 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  53.47 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  53.47 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.24 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1682  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.97 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2702  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.97 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2569  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.97 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.97 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2623  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.97 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2184  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.97 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  51.98 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3133  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.97 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.98 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.98 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.24 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1876  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  54.73 
 
 		 209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  54.23 
 
 		 206 aa  234  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.98 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  53.47 
 
 		 206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.23 
 
 		 222 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.01 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  53.23 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1141  hypothetical protein  53.23 
 
 		 207 aa  231  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  52.74 
 
 		 207 aa  231  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.24 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.23 
 
 		 209 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  53.73 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2764  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.67 
 
 		 211 aa  230  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5412  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.2 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  53.23 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  52.74 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.49 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  52.97 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  51.49 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.2 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  51.49 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  51.49 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  51.49 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  52.97 
 
 		 206 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.5 
 
 		 209 aa  227  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.99 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.24 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.23 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.59 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1625  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.67 
 
 		 211 aa  224  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  50.99 
 
 		 206 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.5 
 
 		 222 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.48 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1527  putative translation factor Sua5  50.72 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  47.26 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.75 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  49.75 
 
 		 206 aa  221  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.76 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3238  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  48.78 
 
 		 207 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.454653  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.47 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.0825487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3276  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.2 
 
 		 211 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0536104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2757  hypothetical protein  51.24 
 
 		 209 aa  214  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.935543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1230  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  50.25 
 
 		 207 aa  214  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000496118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2584  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.2 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0511  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  46.31 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.0100809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>