More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1431 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 		 206 aa  431  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  85.44 
 
 		 206 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  74.63 
 
 		 206 aa  333  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  74.63 
 
 		 213 aa  332  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  73.66 
 
 		 206 aa  328  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2401  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  80.98 
 
 		 206 aa  328  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.907805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2799  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  80.49 
 
 		 206 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.703819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2720  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  80.49 
 
 		 206 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2699  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  80.49 
 
 		 206 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1666  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  80.49 
 
 		 206 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00411691  hitchhiker  0.000419541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1522  translation factor SUA5  79.51 
 
 		 206 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0107346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3016  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  78.54 
 
 		 206 aa  323  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1464  translation factor SUA5  78.05 
 
 		 206 aa  323  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1530  translation factor SUA5  78.05 
 
 		 206 aa  323  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.473863  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2249  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  75.12 
 
 		 206 aa  310  9e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1688  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  75.12 
 
 		 206 aa  310  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  65.53 
 
 		 206 aa  291  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  66.5 
 
 		 206 aa  290  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  66.5 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  64.39 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  64.39 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  64.39 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  64.39 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  64.39 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  64.39 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  64.39 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  64.39 
 
 		 206 aa  280  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  64.39 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  63.11 
 
 		 207 aa  279  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  64.08 
 
 		 206 aa  279  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.62 
 
 		 206 aa  278  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  63.9 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  63.41 
 
 		 206 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  63.41 
 
 		 206 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  63.41 
 
 		 206 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  63.41 
 
 		 206 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  63.41 
 
 		 206 aa  275  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.44 
 
 		 206 aa  274  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  63.41 
 
 		 206 aa  274  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.17 
 
 		 206 aa  274  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  62.44 
 
 		 206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  61.95 
 
 		 206 aa  272  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  61.95 
 
 		 206 aa  272  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  62.93 
 
 		 206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.95 
 
 		 206 aa  271  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60.68 
 
 		 206 aa  268  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  58.05 
 
 		 207 aa  254  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.46 
 
 		 206 aa  254  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3395  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.61 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000157314  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  55.61 
 
 		 209 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  57.07 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.63 
 
 		 221 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  56.31 
 
 		 209 aa  240  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  55.83 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.15 
 
 		 221 aa  237  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.15 
 
 		 221 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.85 
 
 		 207 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  52.2 
 
 		 206 aa  234  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.66 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  51.46 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.59 
 
 		 209 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.49 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  50.97 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  55.12 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.17 
 
 		 209 aa  228  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1876  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.68 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  51.71 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.68 
 
 		 210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.68 
 
 		 210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.68 
 
 		 210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.68 
 
 		 210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.2 
 
 		 210 aa  224  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.68 
 
 		 210 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2310  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60 
 
 		 176 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1682  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2702  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2569  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3133  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2184  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2623  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  50.97 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 		 210 aa  222  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1527  putative translation factor Sua5  50.49 
 
 		 207 aa  222  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  50.24 
 
 		 215 aa  221  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0149272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.76 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.24 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.5 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.15 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1581  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family translation factor  49.76 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132885  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0511  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  48.28 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.0100809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2552  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.76 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000159631  normal  0.146641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1684  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.29 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.66 
 
 		 206 aa  214  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.26 
 
 		 207 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0516  translation factor SUA5  46.8 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.77 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>