More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1175 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  96.17 
 
 
210 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  96.17 
 
 
210 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  96.17 
 
 
210 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  95.69 
 
 
210 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  96.65 
 
 
210 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  96.17 
 
 
210 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  93.78 
 
 
209 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1682  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  91.87 
 
 
209 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2702  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  91.87 
 
 
209 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3133  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  91.87 
 
 
209 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2184  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  91.87 
 
 
209 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2569  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  91.87 
 
 
209 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2623  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  91.87 
 
 
209 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  91.87 
 
 
209 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1581  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family translation factor  84.13 
 
 
211 aa  358  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132885  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2552  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  84.13 
 
 
211 aa  357  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000159631  normal  0.146641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  82.13 
 
 
230 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  70.33 
 
 
215 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0149272  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  73.5 
 
 
207 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  70.53 
 
 
207 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  72.5 
 
 
207 aa  301  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1141  hypothetical protein  71 
 
 
207 aa  296  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3238  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  64.73 
 
 
207 aa  284  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.454653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  64.45 
 
 
211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2757  hypothetical protein  67.94 
 
 
209 aa  276  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.935543  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1003  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  64.65 
 
 
215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  hitchhiker  0.000222561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1625  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  63.51 
 
 
211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1876  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  61.72 
 
 
209 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1684  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.84 
 
 
207 aa  271  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2764  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  63.03 
 
 
211 aa  268  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615539  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  64.93 
 
 
211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2584  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  66.67 
 
 
208 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011828 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.56 
 
 
211 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  57.97 
 
 
210 aa  261  4e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  59.81 
 
 
209 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3276  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60.66 
 
 
211 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0536104  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  60.98 
 
 
207 aa  261  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5412  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.35 
 
 
214 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.02 
 
 
207 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  60.29 
 
 
221 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.81 
 
 
221 aa  257  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.11 
 
 
205 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.85 
 
 
221 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.85 
 
 
221 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  59.51 
 
 
206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  59.51 
 
 
206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3395  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  56.1 
 
 
210 aa  250  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000157314  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.54 
 
 
222 aa  250  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  56.1 
 
 
206 aa  249  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.07 
 
 
206 aa  249  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  59.51 
 
 
209 aa  248  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.51 
 
 
209 aa  248  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  56.1 
 
 
206 aa  248  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1527  putative translation factor Sua5  56.59 
 
 
207 aa  248  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0764912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  247  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.54 
 
 
206 aa  247  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  247  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  247  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  247  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  247  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  58.54 
 
 
218 aa  247  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  247  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  58.54 
 
 
218 aa  247  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  57.56 
 
 
206 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  59.02 
 
 
206 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  58.54 
 
 
206 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  59.02 
 
 
206 aa  244  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  58.05 
 
 
206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  58 
 
 
207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2461  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  58.94 
 
 
208 aa  241  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.742023  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  53.66 
 
 
209 aa  240  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  57.07 
 
 
206 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.61 
 
 
206 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  57.07 
 
 
206 aa  239  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.48 
 
 
207 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  56.1 
 
 
206 aa  238  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  55.12 
 
 
206 aa  236  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.63 
 
 
206 aa  235  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.77 
 
 
209 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  55.12 
 
 
206 aa  235  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.54 
 
 
206 aa  235  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  57.77 
 
 
222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  55.12 
 
 
206 aa  234  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.15 
 
 
209 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.2 
 
 
206 aa  234  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  55.12 
 
 
206 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1728  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.38 
 
 
204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.856761  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.66 
 
 
208 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  54.37 
 
 
207 aa  230  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.88 
 
 
213 aa  230  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.22 
 
 
206 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.78 
 
 
206 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.24 
 
 
206 aa  229  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  53.17 
 
 
206 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  53 
 
 
206 aa  224  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49 
 
 
206 aa  223  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>