More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5017 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5017  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
208 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204159  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1614  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  77.18 
 
 
206 aa  341  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.199609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3021  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  66.34 
 
 
206 aa  284  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.539873  normal  0.0225274 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2001  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.95 
 
 
206 aa  269  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2922  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.62 
 
 
206 aa  259  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1076  translation factor SUA5  57.35 
 
 
208 aa  254  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11213  putative Sua5/yciO/yrdC family protein  57.28 
 
 
206 aa  247  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0717  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.79 
 
 
205 aa  236  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.766931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.74 
 
 
202 aa  208  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.25 
 
 
204 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.74 
 
 
203 aa  197  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.75 
 
 
202 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2120  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.81 
 
 
204 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781433  hitchhiker  0.000757724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.25 
 
 
202 aa  191  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  42.44 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  48.76 
 
 
203 aa  188  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.28 
 
 
202 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.28 
 
 
202 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.06 
 
 
221 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.71 
 
 
206 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.75 
 
 
221 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.93 
 
 
206 aa  185  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.58 
 
 
221 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  40.95 
 
 
209 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.31 
 
 
221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.2 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.83 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  42.51 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  44.71 
 
 
207 aa  178  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.51 
 
 
209 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.77 
 
 
203 aa  177  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3395  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.51 
 
 
210 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000157314  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.78 
 
 
209 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.79 
 
 
213 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.72 
 
 
206 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.27 
 
 
206 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  42.03 
 
 
206 aa  175  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  42.79 
 
 
206 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  42.03 
 
 
206 aa  174  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  41.55 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.55 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2116  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.72 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.839718  normal  0.0783676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.23 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.78 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  40.87 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  40.87 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  40.87 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.87 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  40.87 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  40.87 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  40.87 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  41.06 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  40.87 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  40.87 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.78 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  40.1 
 
 
207 aa  170  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  41.06 
 
 
206 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  41.06 
 
 
206 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  41.06 
 
 
206 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  41.06 
 
 
206 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  41.06 
 
 
206 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3695  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.98 
 
 
217 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  40.78 
 
 
207 aa  168  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2416  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.98 
 
 
217 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.38 
 
 
207 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3016  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.31 
 
 
206 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.32 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.4 
 
 
205 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2168  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.52 
 
 
207 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.426518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.52 
 
 
207 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  41.55 
 
 
206 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  41.55 
 
 
206 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1688  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.83 
 
 
206 aa  164  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2401  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.31 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.907805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1464  translation factor SUA5  41.83 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1530  translation factor SUA5  41.83 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.473863  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2799  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.31 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.703819  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1690  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.82 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2720  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.31 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.23 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564469 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1666  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.31 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00411691  hitchhiker  0.000419541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1688  translation factor SUA5  39.13 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185545  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2699  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.31 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1522  translation factor SUA5  41.35 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0107346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  40.58 
 
 
206 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.68 
 
 
207 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.9 
 
 
206 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.31 
 
 
208 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.94 
 
 
210 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.98 
 
 
210 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.94 
 
 
208 aa  159  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.94 
 
 
210 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.94 
 
 
210 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.38 
 
 
206 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1141  hypothetical protein  37.07 
 
 
207 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.51 
 
 
206 aa  158  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0651  translation factor SUA5  40.19 
 
 
218 aa  157  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585338  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.83 
 
 
222 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.98 
 
 
210 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.98 
 
 
210 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>