More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1564 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  67.5 
 
 		 202 aa  295  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  65.5 
 
 		 203 aa  290  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  66 
 
 		 203 aa  287  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  65.5 
 
 		 202 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  63.5 
 
 		 202 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  63.5 
 
 		 202 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  64.68 
 
 		 203 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2120  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57 
 
 		 204 aa  244  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781433  hitchhiker  0.000757724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.02 
 
 		 202 aa  231  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2116  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.51 
 
 		 235 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.839718  normal  0.0783676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2168  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.97 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.426518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.97 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  46.46 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1688  translation factor SUA5  46.97 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5017  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.25 
 
 		 208 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1614  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.53 
 
 		 206 aa  194  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.199609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  44.95 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0717  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.78 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.766931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44 
 
 		 222 aa  187  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.62 
 
 		 209 aa  187  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  43.63 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.63 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  43.65 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  43.65 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3021  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.36 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.539873  normal  0.0225274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  46.7 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.43 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.08 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.79 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.5 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.93 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.93 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  44.5 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.86 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  42.86 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  42.86 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.42 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  42.13 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  42.13 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  42.13 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  42.13 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.13 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  42.13 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  41.41 
 
 		 206 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.04 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2001  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.45 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  41.84 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0976  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.78 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1038  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.78 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3695  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.6 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2416  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.6 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1475  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.6 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.15 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.15 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  42.56 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.1 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  39.59 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  40.61 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  41.12 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.13 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3395  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.41 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000157314  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  41.12 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1230  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  41.5 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000496118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.12 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11213  putative Sua5/yciO/yrdC family protein  43.78 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1076  translation factor SUA5  41.95 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.12 
 
 		 206 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2922  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.28 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12460  translation factor SUA5  39.7 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.149253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.7 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.13 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0651  translation factor SUA5  37.44 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.61 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1728  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.2 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.856761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.1 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.97 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.76 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0149272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  38.38 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.62 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.61 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  40 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0511  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.12 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.0100809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  37.88 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  41.92 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.1 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.12 
 
 		 207 aa  160  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.5 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.2 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.3 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.0825487 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0516  translation factor SUA5  38.12 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.09 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1141  hypothetical protein  38.69 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>