More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11213 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11213  putative Sua5/yciO/yrdC family protein  100 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206964  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2001  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  73.17 
 
 
206 aa  313  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2922  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  73.66 
 
 
206 aa  309  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3021  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.75 
 
 
206 aa  270  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.539873  normal  0.0225274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1614  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  55.61 
 
 
206 aa  249  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.199609 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1076  translation factor SUA5  57.35 
 
 
208 aa  248  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5017  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.28 
 
 
208 aa  247  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204159  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0717  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.92 
 
 
205 aa  237  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.766931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.8 
 
 
221 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.8 
 
 
221 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.31 
 
 
221 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.32 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  46.12 
 
 
209 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  39.6 
 
 
206 aa  178  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.8 
 
 
203 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.1 
 
 
202 aa  175  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1475  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.71 
 
 
217 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3695  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.34 
 
 
217 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2416  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.34 
 
 
217 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.78 
 
 
202 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.86 
 
 
205 aa  167  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2693  translation factor SUA5  40.85 
 
 
219 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1564  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.78 
 
 
204 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.034899999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  45.23 
 
 
203 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2116  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.57 
 
 
235 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.839718  normal  0.0783676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2120  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.67 
 
 
204 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781433  hitchhiker  0.000757724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.28 
 
 
206 aa  165  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.71 
 
 
210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  40.89 
 
 
209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
213 aa  164  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.93 
 
 
209 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.89 
 
 
209 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.22 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  41.87 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  40.19 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.19 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.18 
 
 
206 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  42.16 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.46 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  40.67 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.67 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  40.19 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  40.67 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  40.67 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  40.67 
 
 
218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  40.67 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  40.67 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.22 
 
 
202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  40.67 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  40.67 
 
 
218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  42.16 
 
 
206 aa  160  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.76 
 
 
209 aa  160  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.76 
 
 
210 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.28 
 
 
202 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.76 
 
 
210 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.71 
 
 
210 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.28 
 
 
202 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  41.67 
 
 
206 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  41.67 
 
 
206 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  41.67 
 
 
206 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  41.67 
 
 
206 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.93 
 
 
206 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.42 
 
 
222 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.56 
 
 
206 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  41.67 
 
 
206 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.3 
 
 
207 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2168  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.3 
 
 
207 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.426518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  41.15 
 
 
206 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2448  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.02 
 
 
206 aa  158  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  41.15 
 
 
206 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
209 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3133  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
209 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1682  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
209 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2702  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
209 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2623  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
209 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1688  translation factor SUA5  41.58 
 
 
231 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2569  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
209 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  39.52 
 
 
207 aa  158  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2184  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.32 
 
 
209 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.42 
 
 
206 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  39.9 
 
 
209 aa  157  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  40.2 
 
 
206 aa  157  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0651  translation factor SUA5  38.21 
 
 
218 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585338  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  41.67 
 
 
206 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.41 
 
 
207 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  40.2 
 
 
206 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.46 
 
 
208 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2401  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.26 
 
 
206 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.907805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4935  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.91 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2699  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.26 
 
 
206 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1527  putative translation factor Sua5  37.02 
 
 
207 aa  155  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2799  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.26 
 
 
206 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.703819  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1666  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.26 
 
 
206 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00411691  hitchhiker  0.000419541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2720  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.26 
 
 
206 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.22 
 
 
203 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3016  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.67 
 
 
206 aa  154  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2350  translation factor SUA5  38.29 
 
 
233 aa  154  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.89 
 
 
209 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1684  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.84 
 
 
207 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>