More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2693 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2693  translation factor SUA5  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4935  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  79.45 
 
 
219 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1475  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  66.67 
 
 
217 aa  309  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3695  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  65.3 
 
 
217 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2416  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  66.21 
 
 
217 aa  307  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3738  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  66.51 
 
 
221 aa  299  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0651  translation factor SUA5  67.12 
 
 
218 aa  298  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.585338  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2350  translation factor SUA5  52.63 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1839  translation factor SUA5  42.99 
 
 
206 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.287256  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.06 
 
 
202 aa  179  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
210 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1682  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
209 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2702  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
209 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.18 
 
 
210 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
209 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2623  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
209 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.52 
 
 
205 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3133  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
209 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
210 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2569  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
209 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2184  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
209 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
209 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  42.52 
 
 
218 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  42.52 
 
 
218 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  42.52 
 
 
206 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.52 
 
 
206 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  42.52 
 
 
206 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  42.52 
 
 
206 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  42.06 
 
 
206 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  42.52 
 
 
206 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  42.52 
 
 
206 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  42.52 
 
 
206 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1596  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.31 
 
 
203 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  41.59 
 
 
206 aa  175  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
210 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.18 
 
 
210 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.18 
 
 
210 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  40.65 
 
 
207 aa  174  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2168  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.81 
 
 
207 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.426518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.81 
 
 
207 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1688  translation factor SUA5  44.29 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.185545  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.59 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1789  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.87 
 
 
202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.23 
 
 
210 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  40.65 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  40.65 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  40.65 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  40.65 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.34 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  41.59 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.87 
 
 
202 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0108242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.34 
 
 
221 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.34 
 
 
221 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.04 
 
 
208 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2116  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.23 
 
 
235 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.839718  normal  0.0783676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  38.86 
 
 
209 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2968  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.42 
 
 
202 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.91 
 
 
206 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  41.12 
 
 
206 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  41.12 
 
 
206 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  41.12 
 
 
206 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.47 
 
 
206 aa  168  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.42 
 
 
202 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1876  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.86 
 
 
209 aa  168  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.86 
 
 
221 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  40.19 
 
 
206 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11213  putative Sua5/yciO/yrdC family protein  40.85 
 
 
206 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.39 
 
 
207 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.38 
 
 
206 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1728  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.38 
 
 
204 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.856761  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  41.12 
 
 
206 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.39 
 
 
230 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1595  translation factor SUA5  41.35 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000829536  normal  0.144642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  39.91 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.81 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.64 
 
 
211 aa  165  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  40.65 
 
 
207 aa  165  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0976  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.48 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1038  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.48 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.44 
 
 
207 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.81 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.65 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  40.19 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.34 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2120  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.42 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.781433  hitchhiker  0.000757724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  38.79 
 
 
209 aa  161  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  40.19 
 
 
206 aa  161  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  37.91 
 
 
207 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  39.25 
 
 
206 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2552  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.85 
 
 
211 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000159631  normal  0.146641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1614  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.6 
 
 
206 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.199609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1843  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.9 
 
 
203 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  36.49 
 
 
215 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0149272  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  39.72 
 
 
206 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  37.85 
 
 
206 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.25 
 
 
206 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.25 
 
 
206 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  40.19 
 
 
206 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1581  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family translation factor  37.38 
 
 
211 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132885  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20060  translation factor SUA5  37.56 
 
 
202 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507285  hitchhiker  0.00225661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>