More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20060  translation factor SUA5  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507285  hitchhiker  0.00225661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2469  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  68.5 
 
 		 206 aa  301  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0137096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2642  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  65.17 
 
 		 206 aa  291  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210491  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3610  hypothetical protein  70.15 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2032  translation factor SUA5  70.65 
 
 		 206 aa  288  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.13835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4990  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  70.15 
 
 		 206 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  69.15 
 
 		 206 aa  280  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000417278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3232  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  66.17 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.049079  normal  0.0745237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0903  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  61.39 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4008  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  67.16 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161552  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12460  translation factor SUA5  59.2 
 
 		 211 aa  259  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.149253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2907  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  62.69 
 
 		 206 aa  254  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2017  SUA5/YciO/YrdC/YwlC family protein  57.29 
 
 		 205 aa  251  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0720523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1076  translation factor SUA5  60.7 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1876  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  54.77 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1795  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  58.71 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00222469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1719  hypothetical protein  54.27 
 
 		 207 aa  241  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2527  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.5 
 
 		 207 aa  240  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1230  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  53.3 
 
 		 207 aa  235  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000496118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3395  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.76 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000157314  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.26 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.225419  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1488  translation factor SUA5  50.25 
 
 		 209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2383  putative translation factor, Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.5 
 
 		 209 aa  234  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2315  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  52.79 
 
 		 210 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3788  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.26 
 
 		 221 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000128856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1527  putative translation factor Sua5  53.73 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33520  translation factor SUA5  64.18 
 
 		 206 aa  229  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00405792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1413  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.26 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.26 
 
 		 221 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1927  hypothetical protein  49.75 
 
 		 209 aa  227  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.75 
 
 		 221 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000384019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15650  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.75 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22830  SUA5/yciO/yrdC family:Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.75 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2170  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.77 
 
 		 206 aa  224  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.687264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1929  hypothetical protein  53.5 
 
 		 206 aa  224  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2040  hypothetical protein  53.5 
 
 		 206 aa  224  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.698074  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1598  hypothetical protein  49 
 
 		 206 aa  224  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1398  hypothetical protein  48.5 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0976  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.27 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1038  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.27 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1079  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.48 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0136774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003091  YrdC family protein  51.76 
 
 		 206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0373896  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0983  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.47 
 
 		 207 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2461  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  50.25 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.742023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1728  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.23 
 
 		 204 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.856761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0719  translation factor SUA5  49.25 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2665  hypothetical protein  52 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1156  hypothetical protein  50.25 
 
 		 206 aa  218  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1811  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.76 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  48.26 
 
 		 222 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1101  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  48.26 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02755  hypothetical protein  50.75 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1141  hypothetical protein  47.98 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1684  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.26 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2310  hypothetical protein  50.75 
 
 		 206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2009  hypothetical protein  50.75 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15072  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3520  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0708  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  51.28 
 
 		 206 aa  214  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.711996  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0799  hypothetical protein  50.5 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2209  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.24 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1062  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.5 
 
 		 206 aa  210  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01241  hypothetical protein  49.75 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2382  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.75 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00338683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1491  hypothetical protein  49.75 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2202  hypothetical protein  49.25 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263235 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01251  hypothetical protein  49.75 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0585  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.02 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1376  hypothetical protein  49.75 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1466  hypothetical protein  49.75 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.748024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2361  hypothetical protein  49.75 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1866  hypothetical protein  49.75 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000433853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1899  hypothetical protein  49.75 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0742  translation factor SUA5  51.02 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5405  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  46.73 
 
 		 210 aa  207  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2127  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.75 
 
 		 206 aa  208  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1930  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.79 
 
 		 206 aa  207  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1431  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.94 
 
 		 230 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2910  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.74 
 
 		 213 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.94 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.939017  hitchhiker  0.000000660923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1065  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  44.78 
 
 		 215 aa  206  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0149272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1645  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.74 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.62 
 
 		 206 aa  204  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.0825487 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5978  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  45.73 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2099  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.73 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2117  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.73 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2552  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.91 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000159631  normal  0.146641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02286  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.23 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2827  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.08 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2009  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.39 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.254165  hitchhiker  0.000210728 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1910  hypothetical protein  48.21 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.570354  hitchhiker  0.000000000000422037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1847  hypothetical protein  48.21 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.10405  hitchhiker  0.000163651 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1852  hypothetical protein  48.21 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1426  hypothetical protein  48.21 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2136  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.39 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0516  translation factor SUA5  42.71 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1581  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family translation factor  45.36 
 
 		 211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132885  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3238  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  45.92 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.454653  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1902  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.72 
 
 		 209 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0511  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.56 
 
 		 205 aa  197  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.0100809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1608  hypothetical protein  47.69 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>