More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0546 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0546  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0229  two component transcriptional regulator  79.2 
 
 		 227 aa  340  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0612  two component transcriptional regulator  76.65 
 
 		 227 aa  329  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3932  two component transcriptional regulator  71.24 
 
 		 226 aa  322  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.95 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 230 aa  192  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  41.7 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 227 aa  187  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  44.93 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.15 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  44.2 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.05 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.41 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  45.98 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45.98 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  44.44 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>