More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8179 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8179  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  41.24 
 
 
299 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2683  glycosyl transferase family protein  38.97 
 
 
295 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2415  glycosyl transferase family 2  37.46 
 
 
293 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0994  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.79 
 
 
624 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165504  decreased coverage  0.00173885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2567  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4200  glycosyl transferase family 2  40.69 
 
 
317 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.852647  normal  0.242959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0603  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2991  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
300 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4436  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  23.71 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
334 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
663 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
361 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  27.87 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4301  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8178  hypothetical protein  100 
 
 
40 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
376 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
336 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  22.17 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  26.23 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
573 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
760 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1054  hypothetical protein  33.09 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  24.89 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
321 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
342 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1126  glycosyl transferase family 2  22.96 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.463481  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.37 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  22.61 
 
 
1067 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
1509 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.57 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  22.43 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
361 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
377 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
832 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
625 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  23.08 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 
354 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
339 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1975  hypothetical protein  35.25 
 
 
348 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0044  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
326 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
370 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  23.29 
 
 
746 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
482 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
632 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0042  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
625 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
625 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  24.02 
 
 
1221 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
476 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
742 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2024  glycosyl transferase family 2  22.09 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2458  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 
340 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00372639  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
742 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
324 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.8 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  24.19 
 
 
1182 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
324 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
765 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0579  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.02 
 
 
348 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1970  putative glycosyl transferase (O-antigen related)  34.02 
 
 
348 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0672  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.02 
 
 
348 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2252  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
360 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
373 aa  52.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  26.62 
 
 
1171 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2212  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
600 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  22.03 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
338 aa  52.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
1035 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
373 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
1032 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  24.44 
 
 
338 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 
324 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
320 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
361 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>